Мероприятия
Секвенирование single cell РНК обеспечивает полную карту клеточных состояний при остром миелоидном лейкозе.
Терапевтическое воздействие на острый миелоидный лейкоз (ОМЛ) затруднено из-за внутри- и межклеточной гетерогенности опухолевых клеток. Чтобы лучше понять клеточные состояния при ОМЛ, создали эталонный атлас гемопоэза человека на основе 263 159 транскриптомных данных отдельных клеток, охватывающих 55 клеточных состояний. Используя этот атлас, нанесли на карту более 1,2 миллиона клеток из 318 образцов лейкемии и выявили 12 повторяющихся паттернов аномальной дифференциации при ОМЛ. Примечательно, что это выявило неожиданные клеточные состояния ОМЛ, напоминающие лимфоидные и эритроидные предшественники, которые были прогностическими в клинически гетерогенном контексте ОМЛ с нормальным кариотипом, независимо от геномных классификаций. Систематическое картирование ассоциаций между генотипом и фенотипом выявило специфические ландшафты дифференцировки, связанные с более чем 45 генетическими факторами. Важно отметить, что из образцов с одним и тем же генетическим фактором могут возникать различные клеточные иерархии, потенциально отражающие различное клеточное происхождение поддерживающих заболевание стволовых клеток лейкемии. Таким образом, точное картирование злокачественных состояний клеток позволяет лучше понять лейкогенез и уточнить классификацию острого лейкоза. Ref: https://doi.org/10.1158/2643-3230.BCD-24-0342

