Слияния генов (фьюжн) представляют собой класс важных онкогенных факторов, при этом многие согласованные таргетные методы лечения, одобренные в том числе FDA, применяются при множественных солидных опухолях. Однако распространенность слияний значительно варьируется в зависимости от типа рака. Обнаружение слияния технически сложно, и исследования показали, что секвенирование нового поколения на основе РНК (NGS) может улучшить показатели обнаружения фьюжинов при использовании в сочетании с NGS на основе ДНК.

В новом исследовании провели ретроспективный панраковый анализ 67 278 пациентов, получавших как РНК-, так и ДНК-NGS анализы при 43 различных типах солидных опухолей, включая: НМРЛ (18,6%), колоректальный рак (18,2%) и рак молочной железы (13,1%). В этой когорте у 1497 пациентов (2,2%) было обнаружено по крайней мере одно из девяти фьюжинов - каждому назначалась одобренная FDA терапия по крайней мере по одному показанию. У 316 пациентов (21,1 %) был выявлен фьюжн (RET или NTRK1/2/3) с соответствующей таргетной терапией, одобренной для лечения соответствующих видов рака. Одновременное секвенирование РНК и ДНК методом NGS повысило эффективность выявления фьюжн генов на 21 % по сравнению с секвенированием ДНК методом NGS. Фьюжины  наблюдались при ряде видов рака, выходящих за рамки утвержденных показаний к раку: из 1501 обнаруженного слияния 29% (n = 437) были обнаружены вне утвержденных FDA показаний. Наконец, новые факторы слияния с мишенями при разработке лекарств были обнаружены еще у 218 пациентов, причем комбинированные РНК- и ДНК-NGS увеличили выявляемость этих вариантов на 127%. Эти результаты подтверждают, что комбинированные РНК-NGS и ДНК-NGS анализы позволяют максимально эффективно выявлять клинически значимые слияния с одобренными подобранными методами лечения и потенциально значимые слияния по показаниям, пока не одобренным профессиональным сообществом, или при сопоставлении с методами лечения, находящимися в стадии клинической разработки.