Иммунное микроокружение и прогностические гены при трижды негативном раке молочной железы в контексте транскриптома и секвенирования отдельных клеток.

Гены, связанные с иммунитетом (IRG), играют ключевую роль в формировании микроокружения опухоли при трижды негативном раке молочной железы (ТНРМЖ). Целью данного исследования было выявление новых прогностических маркеров ТНРМЖ на основе IRG. Анализ дифференциальной экспрессии, однофакторная регрессия Кокса и алгоритмы машинного обучения позволили выявить BPI, GPHA2, KIR3DL3, MASP1, RASGRP1 и SEMA4A в качестве потенциальных прогностических генов. Была разработана и впоследствии подтверждена модель случайного леса выживаемости (Random Survival Forest, RSF), а также создана прогностическая номограмма для оценки эффективности генной диагностики. Кроме того, было установлено, что эпителиальные клетки, фибробласты и Т-клетки являются основными типами клеток, через которые RASGRP1 оказывает своё воздействие. Наконец, анализ иммунного микроокружения и прогнозирование эффективности лекарственных препаратов позволили по-новому взглянуть на лечение тройного негативного рака молочной железы.